Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms