Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms