Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms