Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Clint1Q99KN9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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