Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms