Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1bQ99JY6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1bQ99JY6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1bQ99JY6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1bQ99JY6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1bQ99JY6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1bQ99JY6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1bQ99JY6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1bQ99JY6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1bQ99JY6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1bQ99JY6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1bQ99JY6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms