Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms