Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms