Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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