Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms