Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcaf2Q921K8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcaf2Q921K8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms