Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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