Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek8Q91ZR4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek8Q91ZR4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms