Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdhga12Q91XY7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms