Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms