Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms