Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms