Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casc3Q8K3W3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms