Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms