Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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