Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms