Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms