Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snrnp27Q8K194 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp27Q8K194 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snrnp27Q8K194 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snrnp27Q8K194 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snrnp27Q8K194 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Snrnp27Q8K194 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snrnp27Q8K194 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snrnp27Q8K194 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snrnp27Q8K194 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snrnp27Q8K194 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms