Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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FgbQ8K0E8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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FgbQ8K0E8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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FgbQ8K0E8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms