Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms