Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms