Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms