Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms