Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Lrif1Q8CDD9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Lrif1Q8CDD9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrif1Q8CDD9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Lrif1Q8CDD9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrif1Q8CDD9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Lrif1Q8CDD9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrif1Q8CDD9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrif1Q8CDD9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrif1Q8CDD9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrif1Q8CDD9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrif1Q8CDD9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrif1Q8CDD9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrif1Q8CDD9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrif1Q8CDD9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrif1Q8CDD9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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