Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc22Q8C5N3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms