Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sit1Q8C503 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms