Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms