Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp5Q8BX09 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms