Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Usp38Q8BW70 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Usp38Q8BW70 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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Usp38Q8BW70 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Usp38Q8BW70 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Usp38Q8BW70 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Usp38Q8BW70 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Usp38Q8BW70 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Usp38Q8BW70 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Usp38Q8BW70 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Usp38Q8BW70 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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Usp38Q8BW70 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Usp38Q8BW70 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Usp38Q8BW70 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp38Q8BW70 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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