Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms