Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP97

Rhbdd3, Rhomboid domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd3Q8BP97 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd3Q8BP97 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd3Q8BP97 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rhbdd3Q8BP97 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rhbdd3Q8BP97 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rhbdd3Q8BP97 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rhbdd3Q8BP97 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rhbdd3Q8BP97 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rhbdd3Q8BP97 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rhbdd3Q8BP97 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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