Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms