Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms