Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox2Q8BII1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms