Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atl1Q8BH66 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms