Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot10Q8BH15 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot10Q8BH15 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms