Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Atg4dQ8BGV9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Atg4dQ8BGV9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg4dQ8BGV9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg4dQ8BGV9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg4dQ8BGV9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg4dQ8BGV9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg4dQ8BGV9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg4dQ8BGV9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg4dQ8BGV9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg4dQ8BGV9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg4dQ8BGV9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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