Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Atg4bQ8BGE6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Atg4bQ8BGE6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Atg4bQ8BGE6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Atg4bQ8BGE6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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