Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms