Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms