Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms