Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg2bQ80XK6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms