Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ttc28Q80XJ3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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