Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Zbed4Q80WQ9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Zbed4Q80WQ9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Zbed4Q80WQ9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Zbed4Q80WQ9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Zbed4Q80WQ9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Zbed4Q80WQ9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Zbed4Q80WQ9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Zbed4Q80WQ9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Zbed4Q80WQ9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms