Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm2Q80W85 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Npm2Q80W85 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms